В составе комплекса БГУ функционируют и проводят научно-исследовательскую, опытно-конструкторскую и опытно-технологическую работу 16 факультетов, 4 общеуниверситетских кафедры, 4 научно-исследовательских института, 2 национальных научных центра, Главное управление науки, научно-производственные предприятия, учебные подразделения с правом юридического лица и другие структурные подразделения и организации. В университете успешно работают научные школы в разных областях знаний.
Факультет радиофизики и компьютерных технологий
Факультет прикладной математики и информатики
Механико-математический факультет
Факультет географии и геоинформатики
Факультет философии и социальных наук
Факультет международных отношений
Факультет повышения квалификации и переподготовки
Факультет социокультурных коммуникаций
НИИ прикладных физических проблем им. А.Н.Севченко
Центр физики частиц и высоких энергий (в составе НИИ ядерных проблем)
УО «Международный государственный экологический институт им. А.Д. Сахарова»
ГУО «Институт бизнеса Белорусского государственного университета»
ГУО «Институт теологии имени святых Мефодия и Кирилла» БГУ
ГУО «Институт повышения квалификации и переподготовки в области технологий информатизации и управления» БГУ
НИЛ прикладной механики (она же «Геоинформационные технологии в геомеханике и геодинамике», совместная: каф. теоретической и прикладной механики и ЗАО «Экомир»)
НИЛ информационных технологий и компьютерной графики
НИЛ прикладного вероятностного анализа
Учебно-научно-практическая лаборатория по RFID-технологиям
НИЛ клеточной инженерии и нанобиотехнологий
НИЛ диэлектрической спектроскопии гетерогенных систем
НИЛ нелинейной оптики и спектроскопии
НИЛ энергоэффективных материалов и технологий
НИЛ спектроскопии полупроводников
НИЛ физики электронных материалов
НИЛ физики и техники полупроводников
НИЛ высокоэнергетичной ионной имплантации и функциональной диагностики
НИЛ физики ионно-плазменной модификации твердых тел
НИЛ научного приборостроения
НИЛ материалов и приборных структур микро- и наноэлектроники
НИЛ информационно-измерительных систем
НИЛ прикладных космических технологий
НИЛ методов обработки информации
НИЛ неорганической и общей химии
НИЛ химико-аналитических систем
НИЛ элементоорганического синтеза
НИЛ физической химии конденсированных сред
НИЛ прикладных проблем токсичности продуктов горения
НИЛ молекулярной генетики и биотехнологии
НИЛ физиологии и биотехнологии растений
НИЛ биохимии и фармакологии биологически активных веществ
